我想用IPython笔记本电脑来交互式分析我用Biopython的基因组图模块制作的一些基因组图。虽然有大量关于如何使用matplotlib在IPython笔记本中获得内联图形的文档，但GenomeDiagram使用ReportLab工具包，我认为IPython不支持该工具包。

然而，我在想，一种解决这个问题的方法是将绘图/基因组图写入一个文件，然后内联打开图像，结果会是这样的:

gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")

然而，我不知道如何做到这一点，也不知道这是否可行。那么有人知道IPython中是否可以打开/显示图像吗?

当我打开Jupyter笔记本(以前是IPython)时，它默认为c:\ users \ username

我如何将其更改为另一个位置?

我想得到的时间花在单元格执行除了原始的输出从单元格。

为此，我尝试了%%timeit -r1 -n1，但它没有公开在cell中定义的变量。

%%time适用于只包含1条语句的cell。

In[1]: %%time
       1
CPU times: user 4 µs, sys: 0 ns, total: 4 µs
Wall time: 5.96 µs
Out[1]: 1

In[2]: %%time
       # Notice there is no out result in this case.
       x = 1
       x
CPU times: user 3 µs, sys: 0 ns, total: 3 µs
Wall time: 5.96 µs

最好的方法是什么?

更新

我已经在nbeextension中使用执行时间相当长一段时间了。这是伟大的。

更新2021 - 03

到目前为止，这是正确的答案。从本质上讲，%%time和%%timeit现在都像预期的那样工作。

我开始严重依赖IPython笔记本应用程序来开发和记录算法。这太棒了;但有些事情看起来应该是可能的，但我不知道该怎么做:

I would like to insert a local image into my (local) IPython notebook markdown to aid in documenting an algorithm. I know enough to add something like <img src="image.png"> to the markdown, but that is about as far as my knowledge goes. I assume I could put the image in the directory represented by 127.0.0.1:8888 (or some subdirectory) to be able to access it, but I can't figure out where that directory is. (I'm working on a mac.) So, is it possible to do what I'm trying to do without too much trouble?

我有木星/anaconda/python3.5。

我如何知道我的jupyter笔记本在哪个conda环境上运行? 如何从新的conda环境中启动jupyter ?

我用的是iPython笔记本。当我这样做的时候:

df

我得到一张漂亮的有细胞的桌子。然而，如果我这样做:

df1
df2 

它不会打印第一个漂亮的表格。如果我这样做:

print df1
print df2

它以一种不同的格式打印表，这种格式将列溢出，并使输出非常高。

有没有办法强迫它为两个数据集打印出漂亮的表格?

我已经在jupyter笔记本上运行了大约26个小时的脚本;我没有真正使用我的电脑做任何其他事情，但它需要运行这个程序，需要大约30个小时才能完成。大约21小时后，它停止保存，我的终端出现了这样的情况:

403 PUT /api/contents/[file.ipynb] (::1): '_xsrf' argument missing from POST

(文件的地方。Ipynb]是我的jupyter笔记本的位置。它还说:

'_xsrf' argument missing from post

在笔记本的右上角。程序仍在运行，我不想重新启动jupyter notebook，不得不再次运行程序，因为我有一个截止日期，还有什么我可以做的吗?

我使用谷歌chrome，但我没有LastPass扩展或任何'%'字符在我的代码，作为另一个帖子建议。

谢谢你的帮助!

如何在IPython Notebook中显示LaTeX代码?

我想注释掉在Jupyter笔记本多行块，但不知道如何做到这一点在当前版本。 它曾经在一个下拉菜单中，但现在不存在了。 如何一次注释掉多行代码块?

这不是一个副本，因为在下面的链接给出的解决方案似乎不再工作: 如何在IPython笔记本中阻止注释代码?

Ctrl + /什么都不做。

我的Jupyter笔记本电脑安装了python 2内核。我不明白为什么。我可能在安装的时候搞砸了。我已经安装了python 3。我怎么能把它加到木星上? 下面是默认的Jupyter使用python3 -m install Jupyter安装并在浏览器中使用Jupyter notebook打开的截图: