我之前遇到过这个问题，并通过以下步骤解决了它:

右键单击“外部库”并选择“加载/卸载模块”按钮

如果您看到模块已经加载，请再次执行卸载/加载，因为这是由于IntelliJ中的错误造成的。

完成此操作后，在External Libraries部分的顶部再次看到该项目。

我是IntelliJ IDEA 2016.2的新用户。当我第一次运行该程序时，我打开了一个现有的项目，并且有相同的问题，其中它只显示根目录中的文件在1。项目面板，而不是项目文件夹(可展开的树状结构)。

最初，我尝试去项目设置>模块，那里没有显示列出的模块。我点击(+)，并试图选择我的根文件夹，但它不会选择文件夹。

所以我用以下步骤来解决这个问题:

Exit IntelliJ Delete the existing .idea folder (i.e. rm -rf .idea) Restart IntelliJ Verified that the project root folder now appeared (in Project Settings > Modules) Toggle On the toolbar buttons (i.e. 1. Project Structure) to display on the left sidebar (clicked View > Toolbar Buttons until tick appears) Click 1. Project Structure toolbar button until its sidebar is revealed Click the arrow icon on the left of your project's root directory name that appears to expand the tree folder structure

2017年9月2日更新:如果你已经添加了一个模块SDK，并且它在你的项目根目录的子目录中添加了一个。iml文件，这导致它加载模块子目录，那么你可能需要修改这个。iml文件，通过追加/..如下图所示。

  <component name="NewModuleRootManager" inherit-compiler-output="true">
    <exclude-output />
    <content url="file://$MODULE_DIR$/..">

对于我在IntelliJ，它显示我一个弹出框导入现有的项目作为gradle项目。我只是点击确定，然后文件夹结构显示正确。

将“Project”下拉菜单改为“Project Files”

我知道这并没有回答涉及Maven模块的OPs问题，但这是截至2021年7月谷歌上的第一个搜索结果，当时试图调试为什么文件夹在IntelliJ中不能正确显示

项目结构=>模块=>选择你的模块=>路径=>确保选择了“继承项目编译输出路径”

Intellij在解决所有依赖项后导入项目。在我的情况下，它无法解决某些模块的依赖关系，并被卡在那里。我必须将Maven settings.xml从本地回收复制到默认的.m2文件夹，以便将其指向正确的本地回收。