我也有这个问题。 它与.idea有关，只需删除它并重新启动IntelliJ

为了完整性，添加这个答案。我在使用15.0.6时遇到了这个问题。我真的从Maven或Gradle导入一个模块，它通过了这个过程，但模块没有出现。我尝试删除。idea文件并重新启动。卸载并安装最新版本(社区2016.2)解决了这个问题。

项目结构=>模块=>选择你的模块=>路径=>确保选择了“继承项目编译输出路径”

删除项目文件夹中的。idea 使用项目文件夹作为现有源代码创建一个新项目

我是IntelliJ IDEA 2016.2的新用户。当我第一次运行该程序时，我打开了一个现有的项目，并且有相同的问题，其中它只显示根目录中的文件在1。项目面板，而不是项目文件夹(可展开的树状结构)。

最初，我尝试去项目设置>模块，那里没有显示列出的模块。我点击(+)，并试图选择我的根文件夹，但它不会选择文件夹。

所以我用以下步骤来解决这个问题:

Exit IntelliJ Delete the existing .idea folder (i.e. rm -rf .idea) Restart IntelliJ Verified that the project root folder now appeared (in Project Settings > Modules) Toggle On the toolbar buttons (i.e. 1. Project Structure) to display on the left sidebar (clicked View > Toolbar Buttons until tick appears) Click 1. Project Structure toolbar button until its sidebar is revealed Click the arrow icon on the left of your project's root directory name that appears to expand the tree folder structure

2017年9月2日更新:如果你已经添加了一个模块SDK，并且它在你的项目根目录的子目录中添加了一个。iml文件，这导致它加载模块子目录，那么你可能需要修改这个。iml文件，通过追加/..如下图所示。

  <component name="NewModuleRootManager" inherit-compiler-output="true">
    <exclude-output />
    <content url="file://$MODULE_DIR$/..">

操作系统:Mac && IDE: IntelliJ &&项目:Maven构建

导航到文件>项目结构>模块。 在右边区域;将显示模块列表。 删除所选的默认选项，并关闭IntelliJ。 再次开放;IntelliJ将询问您是否要处理该项目 Maven项目。 接受弹出窗口，您就可以开始了。