更新:我现在认为这个答案已经过时了。我在下面发布了一个新的完美解决方案。

如果您的makefile可能运行在非cygwin Windows上，uname可能不可用。这很尴尬，但这是一个潜在的解决方案。您必须首先检查Cygwin以排除它，因为它的PATH环境变量中也有WINDOWS。

ifneq (,$(findstring /cygdrive/,$(PATH)))
    UNAME := Cygwin
else
ifneq (,$(findstring WINDOWS,$(PATH)))
    UNAME := Windows
else
    UNAME := $(shell uname -s)
endif
endif

注意，makefile对空格非常敏感。下面是一个Makefile的例子，它在OS X上运行一个额外的命令，并且可以在OS X和Linux上运行。不过，总的来说，autoconf/automake是解决所有非平凡问题的方法。

UNAME := $(shell uname -s)
CPP = g++
CPPFLAGS = -pthread -ansi -Wall -Werror -pedantic -O0 -g3 -I /nexopia/include
LDFLAGS = -pthread -L/nexopia/lib -lboost_system

HEADERS = data_structures.h http_client.h load.h lock.h search.h server.h thread.h utility.h
OBJECTS = http_client.o load.o lock.o search.o server.o thread.o utility.o vor.o

all: vor

clean:
    rm -f $(OBJECTS) vor

vor: $(OBJECTS)
    $(CPP) $(LDFLAGS) -o vor $(OBJECTS)
ifeq ($(UNAME),Darwin)
    # Set the Boost library location
    install_name_tool -change libboost_system.dylib /nexopia/lib/libboost_system.dylib vor
endif

%.o: %.cpp $(HEADERS) Makefile
    $(CPP) $(CPPFLAGS) -c $

我今天遇到了这个问题，我需要在Solaris上使用它，所以这里有一种POSIX标准方法(非常接近)。

#Detect OS
UNAME = `uname`

# Build based on OS name
DetectOS:
    -@make $(UNAME)


# OS is Linux, use GCC
Linux: program.c
    @SHELL_VARIABLE="-D_LINUX_STUFF_HERE_"
    rm -f program
    gcc $(SHELL_VARIABLE) -o program program.c

# OS is Solaris, use c99
SunOS: program.c
    @SHELL_VARIABLE="-D_SOLARIS_STUFF_HERE_"
    rm -f program
    c99 $(SHELL_VARIABLE) -o program program.c

git makefile包含了许多如何在没有autoconf/automake的情况下进行管理的示例，但仍然可以在许多unix平台上工作。

不带参数的uname命令(http://developer.apple.com/documentation/Darwin/Reference/ManPages/man1/uname.1.html)应该告诉您操作系统的名称。我会使用它，然后根据返回值创建条件。

例子

UNAME := $(shell uname)

ifeq ($(UNAME), Linux)
# do something Linux-y
endif
ifeq ($(UNAME), Solaris)
# do something Solaris-y
endif

这就是GNU的automake/autoconf设计用来解决的问题。你可能想调查一下。

或者，您可以在不同的平台上设置环境变量，并根据它们设置Makefile条件。