如果你的查询有blob数据，这个问题可以通过应用my.ini更改来修复，就像在这个答案中提出的那样:

[mysqld]
max_allowed_packet=16M

默认情况下，这将是1M(允许的最大值是1024M)。如果提供的值不是1024K的倍数，它将自动舍入到1024K的最接近倍数。

虽然引用的线程是关于MySQL错误2006，设置max_allowed_packet从1M到16M确实修复了2013年的错误，当我运行一个长查询时出现。

对于WAMP用户:您将在[wampmysqld]部分中找到该标志。

我知道它很老，但在mac上

1. Control-click your connection and choose Connection Properties.
2. Under Advanced tab, set the Socket Timeout (sec) to a larger value.

只需执行一次MySQL升级，将重新构建innoDB引擎，并重新构建MySQL正常运行所需的许多表，如performance_schema, information_schema等。

从你的shell中发出下面的命令:

sudo mysql_upgrade -u root -p

我在运行一个存储过程时遇到了这个问题——它正在数据库中的一个表中创建大量的行。 在超过30秒后，我就看到了这个错误。

我尝试了其他答案中的所有建议。我确信其中有一些帮助，然而，真正让我有用的是从Workbench切换到SequelPro。

我猜这是我在Workbench中没有发现的某个客户端连接。 也许这也能帮助到其他人?

如果这里所有其他解决方案都失败了，请检查您的syslog (/var/log/syslog或类似)，看看您的服务器在查询期间是否内存不足。

当innodb_buffer_pool_size设置得太接近物理内存而没有配置交换文件时出现此问题。MySQL建议将innodb_buffer_pool_size设置为物理内存的80%左右，我将其设置为90%左右，内核正在杀死MySQL进程。将innodb_buffer_pool_size移回80%左右，解决了这个问题。

SET @@local.net_read_timeout=360;

警告:当您在远程连接中应用它时，以下将不起作用:

SET @@global.net_read_timeout=360;

编辑:360是秒数