这通常意味着你有“与当前版本的MySQL服务器不兼容”，参见mysql_upgrade。我也遇到了同样的问题，我不得不跑掉:

mysql_upgrade——密码 文档声明，“mysql_upgrade应该在每次升级MySQL时执行”。

我在运行一个存储过程时遇到了这个问题——它正在数据库中的一个表中创建大量的行。 在超过30秒后，我就看到了这个错误。

我尝试了其他答案中的所有建议。我确信其中有一些帮助，然而，真正让我有用的是从Workbench切换到SequelPro。

我猜这是我在Workbench中没有发现的某个客户端连接。 也许这也能帮助到其他人?

我知道它很老，但在mac上

1. Control-click your connection and choose Connection Properties.
2. Under Advanced tab, set the Socket Timeout (sec) to a larger value.

使用命令行选项net_read_timeout / wait_timeout和一个合适的值(以秒为单位)启动DB服务器，例如:——net_read_timeout=100。

参考资料见这里和这里。

你应该在mysql配置文件中设置'interactive_timeout'和'wait_timeout'属性为你需要的值。

新版本的MySQL WorkBench有一个选项可以更改特定的超时时间。

对我来说，它是在编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS连接读取超时时间(秒):600

将值更改为6000。

此外，不勾选限制行，因为每次我想搜索整个数据集时都要设置一个限制，这会让人感到厌烦。