我试图在一个高水平上理解R Markdown和R NoteBook之间的区别。我知道它们是相互关联的，但我想弄清楚它们是如何相互关联的。我的理解是:
我知道R笔记本实际上是R Markdown文档，但我对术语感到困惑。
RStudio新文件选项有R Markdown和R NoteBook，选择其中任何一个打开R Markdown文件，但有微小的差异。我只是想弄清楚为什么会有两种选择这两者之间有什么区别?
我知道R笔记本电脑是新推出的，R Markdown也已经有一段时间了。部分困惑可能是因为在R笔记本推出之前我从未使用过R Markdown，所以我的相关或更具体的问题是
R NoteBook与仅仅使用R MarkDown有什么不同，或者R NoteBook带来了什么新功能?
我在网上搜索的所有结果都指向R Notebook使用了R Markdown，但我没有找到任何关于两者之间具体区别的帮助。
当前回答
当然，R文件中包含R编程语言代码。
R Markdown, on the other hand, is a Markdown file ("Markdown is a lightweight markup language for creating formatted text using a plain-text editor" per daringfireball.net/projects/markdown) with R code chunks embedded within it. R code chunks afford the option of running the whole chunk or a single line within RStudio. Even more important is when you go to export your R Markdown file you will see that the Markdown text shows up as text, while R code chunks are grayed and show up as a code block by default. RMarkdown is meant to make R more dynamic, especially for the purposes of creating reports. R Markdown has been used extensively by the scientific community for the purposes of generating reports.
其他回答
据我所知，从我的设置没有编码差异。 区别在于渲染。文件扩展名相同。
当你创建一个新的R Notebook时，它会在头文件的输出选项中添加html_notebook。这就是区别。然后，您可以快速预览渲染，而不必编织它。它还会在每次保存时刷新预览。然而，在预览中，你没有代码输出(没有图形，没有表格..)(至少在我的设置中)。输出中没有html_notebook，就没有按钮预览
正如你可以看到预览选项显示，但你也可以编织在任何你想要的格式。当您这样做时，它将把它添加到头代码中。
然而，如果你的标题中没有html_notebook，你只能编织你的代码来看看它看起来像什么(整本书)(请忽略我在图片中添加的额外默认选项)
下拉菜单中没有显示预览选项
否则它的工作原理是一样的。对于某些默认配置，输出在默认情况下也隐藏在代码部分中。
注意，你可以在你的标题中混合几个输出选项，这样你就可以保持预览，并保持你的针织选项用于导出。
从jrnold:
R笔记本文件在编辑器中显示输出，同时隐藏控制台。R markdown文件显示控制台内的输出，而不显示编辑器内的输出。它们的YAML头中的输出值不同。 R笔记本的YAML标题将有这样一行，
---
ouptut: html_notebook
---
R markdown文件的YAML头将有一行，
ouptut: html_document
将YAML头从R笔记本复制到R markdown文件将其更改为R markdown文件，反之亦然。更具体地说，将output的值更改为This是因为RStudio IDE在打开文件时使用YAML头，编织时使用rmarkdown包，特别是YAML头中的输出键的值，以确定它是什么类型的文档。
以下是我发现的一个实际差异:
当你需要注释掉文本的一部分时， RMarkdown在文本的每一行中插入#，而 RNotebook简洁地封装了一对<!——，——>符号(在HTML文件中)
有人可能会说，差别太小了。然而，正因为如此，我现在总是在RStudio中使用R Notebook(而不是RMarkdown)来保存我的所有文档。在其他方面，它们似乎是一样的(至少对于我的需求，比如生成html和pdf)
否则，我的注释就会突然变成标题，如下所示:
# This part is commented out, but will show as Heading 1 font text
http://rmarkdown.rstudio.com/r_notebooks.html#notebook_file
普通的Markdown文件是“编织”的，但笔记本是“预览”的。 而笔记本预览看起来类似于渲染的R Markdown 文档，笔记本预览不执行任何R代码 块”
最近我发现了一篇文章，让我清楚了R Markdown和R Notebook的问题。 http://uc-r.github.io/r_notebook
以下是一些相关的句子:
编写R Notebook文档与编写R Markdown文档没有什么不同。文本和代码块的语法与您在R Markdown教程中学到的没有什么不同。主要的区别在于R笔记本的互动性。主要是当在R Markdown文档中执行块时，所有的代码都被一次性发送到控制台，但在R Notebook中，一次只发送一行。这允许在某行引发错误时停止执行。
当你在RStudio中创建R Notebook时，也有这个关于编织和预览的问题:
预览显示了编辑器内容的HTML副本。因此，与Knit不同，Preview不运行任何R代码块。相反，将显示上一次在编辑器中运行时的数据块的输出。
希望对你有用。
