我在使用IntelliJ IDEA 14.01时遇到了这个问题。

我可以通过以下方法修复它:

文件->项目结构->添加新的(工件)->jar->从模块与依赖创建jar从模块窗口:

选择你的主要类

来自库的JAR文件 选择复制到输出目录和链接通过清单

对于使用kotlin脚本(kts)作为构建脚本的人:

task("fatJar", type = Jar::class) {
baseName = "${project.name}-fat"
manifest {
    attributes["Implementation-Title"] = "Watcher Jar File"
    attributes["Implementation-Version"] = version
    attributes["Main-Class"] = "MainKt"
}
from(configurations.runtimeClasspath.get().map { if (it.isDirectory) it else zipTree(it) }) {
    exclude(listOf("META-INF/*.RSA", "META-INF/*.SF", "META-INF/*.DSA"))
}
with(tasks.jar.get() as CopySpec)

}

有些依赖项可能是带符号的jarfile。当您将它们全部组合到一个大的jarfile中时，相应的签名文件仍然存在，并且不再与“大的组合”jarfile匹配，因此运行时停止认为jar文件已被篡改(它…可以这么说)。

假设您正在使用ant，可以通过从jarfile依赖项中删除签名文件来解决这个问题。不幸的是，在ant中不可能一步到位。

但是，我能够在Ant中分两步实现这个功能，而不需要具体地命名每个jarfile依赖项，通过使用:

<target name="jar" depends="compile" description="Create one big jarfile.">
    <jar jarfile="${output.dir}/deps.jar">
        <zipgroupfileset dir="jars">
            <include name="**/*.jar" />
        </zipgroupfileset>
    </jar>
    <sleep seconds="1" />
    <jar jarfile="${output.dir}/myjar.jar" basedir="${classes.dir}">
        <zipfileset src="${output.dir}/deps.jar" excludes="META-INF/*.SF" />
        <manifest>
            <attribute name="Main-Class" value="com.mycompany.MyMain" />
        </manifest>
    </jar>
</target>

sleep元素的作用是防止将来出现关于修改日期的文件的错误。

我在链接线程中发现的其他变化并不适合我。

有可能是两个不同的签名者搞砸了java思维。

尝试从jar中删除META-INF文件夹，再次添加清单和签名jar，它帮助了我:http://jehy.ru/articles/2013/12/13/invalid-signature-file-digest-for-manifest-main-attributes/

比较新jar和旧jar中的META-INF文件夹(在添加新库之前)。有可能会有新的文件。如果是，可以删除。这应该会有所帮助。 问候, 999米甲

我也遇到过同样的问题，经过参考，它的工作原理如下:

<plugin>
    <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
    <artifactId>maven-shade-plugin</artifactId>
    <version>3.2.1</version>
    <configuration>
        <createDependencyReducedPom>false</createDependencyReducedPom>
    </configuration>
    <executions>
        <execution>
            <phase>package</phase>
            <goals>
                <goal>shade</goal>
            </goals>
            <configuration>
                <filters>
                    <filter>
                        <artifact>*:*</artifact>
                        <excludes>
                            <exclude>META-INF/*.SF</exclude>
                            <exclude>META-INF/*.DSA</exclude>
                            <exclude>META-INF/*.RSA</exclude>
                        </excludes>
                    </filter>
                </filters>
            </configuration>
        </execution>
    </executions>
</plugin>