如何从一个简单的线性回归模型中提取p值(单个解释变量的系数的显著性为非零)和r平方值?例如……
x = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
y = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
fit = lm(y ~ x)
summary(fit)
我知道summary(fit)显示了p值和r平方值,但我希望能够将它们插入到其他变量中。
如何从一个简单的线性回归模型中提取p值(单个解释变量的系数的显著性为非零)和r平方值?例如……
x = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
y = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
fit = lm(y ~ x)
summary(fit)
我知道summary(fit)显示了p值和r平方值,但我希望能够将它们插入到其他变量中。
当前回答
另一个选择是使用cor.test函数,而不是lm:
> x <- c(44.4, 45.9, 41.9, 53.3, 44.7, 44.1, 50.7, 45.2, 60.1)
> y <- c( 2.6, 3.1, 2.5, 5.0, 3.6, 4.0, 5.2, 2.8, 3.8)
> mycor = cor.test(x,y)
> mylm = lm(x~y)
# r and rsquared:
> cor.test(x,y)$estimate ** 2
cor
0.3262484
> summary(lm(x~y))$r.squared
[1] 0.3262484
# P.value
> lmp(lm(x~y)) # Using the lmp function defined in Chase's answer
[1] 0.1081731
> cor.test(x,y)$p.value
[1] 0.1081731
其他回答
x = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
y = cumsum(c(0, runif(100, -1, +1)))
fit = lm(y ~ x)
> names(summary(fit))
[1] "call" "terms"
[3] "residuals" "coefficients"
[5] "aliased" "sigma"
[7] "df" "r.squared"
[9] "adj.r.squared" "fstatistic"
[11] "cov.unscaled"
summary(fit)$r.squared
使用:
(summary(fit))$coefficients[***num***,4]
其中num是一个数字,表示系数矩阵的行。这取决于你的模型中有多少特征,以及你想为哪一个提取p值。例如,如果你只有一个变量,那么截距的p值将是[1,4],下一个是你的实际变量的p值将是[2,4]。所以你的num是2。
通过调用str(summary(fit))可以看到summary()返回的对象的结构。每个片段都可以使用$访问。F统计量的p值更容易从方差分析返回的对象中得到。
简单地说,你可以这样做:
rSquared <- summary(fit)$r.squared
pVal <- anova(fit)$'Pr(>F)'[1]
对于summary()末尾显示的最终p值,该函数使用pf()从summary(fit)$fstatistic值中计算。
fstat <- summary(fit)$fstatistic
pf(fstat[1], fstat[2], fstat[3], lower.tail=FALSE)
来源:[1],[2]
注意,summary(fit)生成了一个包含您需要的所有信息的对象。se t和p向量都存储在里面。通过选择系数矩阵的第4列来获得p值(存储在summary对象中):
summary(fit)$coefficients[,4]
summary(fit)$r.squared
尝试str(summary(fit))查看该对象包含的所有信息。
编辑:我误解了蔡斯的答案,它基本上告诉你如何得到我在这里给出的东西。