总而言之，这是您应该做的：

设置path_to_submodule变量（无尾随斜杠）：

path_to_submodule=path/to/submodule

从.gitmodules文件中删除相关行：

git config -f .gitmodules --remove-section submodule.$path_to_submodule

从.git/config中删除相关部分

git config -f .git/config --remove-section submodule.$path_to_submodule

仅从索引中取消存储并删除$path_to_submodule（以防止丢失信息）

git rm --cached $path_to_submodule

跟踪对.gitmodules所做的更改

git add .gitmodules

提交超级项目

git commit -m "Remove submodule submodule_name"

删除现在未跟踪的子模块文件

rm -rf $path_to_submodule

rm -rf .git/modules/$path_to_submodule

另请参见：备选指导线

要删除添加的子模块，请使用：

REPOSITORY=blah@blah.com:repos/blah.git
MOD_DIR=lib/blah
git submodule add $REPOSITORY $MOD_DIR

Run:

git rm $MOD_DIR

就是这样。

对于旧版本的git（约为1.8.5，实际上甚至在2.26.2中），请使用：

git submodule deinit $MOD_DIR
git rm $MOD_DIR
git config -f .gitmodules --remove-section submodule.$MOD_DIR

使用Magit的简单解决方案

如果您在Emacs下使用Magit，则可以执行以下操作：

转到项目根目录，然后

M-x，magit列表子模块

then

M-x，删除magit子模块

系统将询问您要删除哪个子模块。

就是这样！

（我的Magit版本是v3.3.0）

我不得不进一步执行John Douth的步骤，并将其cd到子模块的目录中，然后删除Git存储库：

cd submodule
rm -fr .git

然后，我可以将文件作为父Git存储库的一部分提交，而无需对子模块的旧引用。

总而言之，这是您应该做的：

设置path_to_submodule变量（无尾随斜杠）：

path_to_submodule=path/to/submodule

从.gitmodules文件中删除相关行：

git config -f .gitmodules --remove-section submodule.$path_to_submodule

从.git/config中删除相关部分

git config -f .git/config --remove-section submodule.$path_to_submodule

仅从索引中取消存储并删除$path_to_submodule（以防止丢失信息）

git rm --cached $path_to_submodule

跟踪对.gitmodules所做的更改

git add .gitmodules

提交超级项目

git commit -m "Remove submodule submodule_name"

删除现在未跟踪的子模块文件

rm -rf $path_to_submodule

rm -rf .git/modules/$path_to_submodule

另请参见：备选指导线

使用git v2.7.4，简单的3个步骤就可以了。

git submodule deinit -f -- a/submodule    
git rm -f a/submodule
git commit