我在Windows上运行R,不是作为管理员。当我安装一个包时,下面的命令不起作用:

> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable

要安装一个包,我必须指定一个库位置:

install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")

要加载一个包,我还必须指定库的位置:

library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")

所有这些都没问题,但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中,这样就不必每次都输入它了。

当我在网上搜索时,我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

然而,在这样做并启动RStudio之后,这是我得到的输出

> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library" 

我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是,如何解决这个问题,以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?

注意:如果我启动RStudio, .libPaths()命令似乎可以正常工作

.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"

这不是很奇怪吗?


当前回答

我真的很难理解。当我上次重新安装OS & Rstudio时,gorkypl给出了正确的解决方案,但这一次,设置我的环境变量没有解决。

卸载R和Rstudio,创建目录C:\R和C:\Rstudio,然后重新安装它们。

将R_LIBS_USER用户变量定义到您的首选目录(根据gorkypl的回答),并重新启动您的机器以加载user变量。打开Rstudio,错误应该消失了。

您还可以使用Sys.setenv()将R_LIBS_USER修改为您的替代库的路径,这更容易,而且不需要重新启动您的计算机。

要查看R_LIBS_USER设置为什么: ? Sys.getenv ()

阅读帮助(启动)是有用的。

其他回答

我也遇到过同样的问题,我遇到了这个。如果你想创建另一个位置c(" c:/Users/mynewlocation")也应该可以工作。正如这里提到的“您应该能够右键单击Rstudio.exe图标,单击属性,并选择一个选项,始终以管理员身份运行Rstudio。当你想打开Rstudio时,一定要使用相同的图标。”

    myPaths <- .libPaths()   # get the paths
myPaths <- c(myPaths[2], myPaths[1])  # switch them
.libPaths(myPaths)  # reassign them

如果您的默认包库在安装R的新版本或通过任何其他方式更改了,您可以在下面的命令的帮助下附加这两个库以使用所有包。 获取现有库路径:

.libPaths()

现在,设置现有路径和旧路径:

libPaths (c (libPaths()、“~ - yourOldPath”)

希望能有所帮助。

正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值,而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER,请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径),例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages  

如果由于某种原因您无法访问控制面板,您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行,并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中,无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio,那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下,将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时,Rprofile解决方案不起作用,因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

getwd()
# [1] "C:/Users/..../software/My R studio"

复制上面的链接,带两个倒置逗号

.libPaths(new="C:/Users/..../software/My R studio")

安装包的默认路径将更改

在Ubuntu上,为用户更改默认库路径的推荐方法是在~/. conf中设置R_LIBS_USER变量。Renviron文件。

touch ~/.Renviron
echo "R_LIBS_USER=/custom/path/in/absolute/form" >> ~/.Renviron