现代Python（3.6+）使用pathlib模块对路径进行类似OOP的简洁处理，使用pathlib.Path.rglob（）进行递归globing。据我所知，这相当于乔治·V·莱利的回答：压缩压缩，最顶层的元素是目录，保持空目录，使用相对路径。

from pathlib import Path
from zipfile import ZIP_DEFLATED, ZipFile

from os import PathLike
from typing import Union


def zip_dir(zip_name: str, source_dir: Union[str, PathLike]):
    src_path = Path(source_dir).expanduser().resolve(strict=True)
    with ZipFile(zip_name, 'w', ZIP_DEFLATED) as zf:
        for file in src_path.rglob('*'):
            zf.write(file, file.relative_to(src_path.parent))

注意：如可选类型提示所示，zip_name不能是Path对象（将在3.6.2+中修复）。

我还有另一个代码示例可能会有所帮助，使用python3、pathlib和zipfile。它应该可以在任何操作系统中工作。

from pathlib import Path
import zipfile
from datetime import datetime

DATE_FORMAT = '%y%m%d'


def date_str():
    """returns the today string year, month, day"""
    return '{}'.format(datetime.now().strftime(DATE_FORMAT))


def zip_name(path):
    """returns the zip filename as string"""
    cur_dir = Path(path).resolve()
    parent_dir = cur_dir.parents[0]
    zip_filename = '{}/{}_{}.zip'.format(parent_dir, cur_dir.name, date_str())
    p_zip = Path(zip_filename)
    n = 1
    while p_zip.exists():
        zip_filename = ('{}/{}_{}_{}.zip'.format(parent_dir, cur_dir.name,
                                             date_str(), n))
        p_zip = Path(zip_filename)
        n += 1
    return zip_filename


def all_files(path):
    """iterator returns all files and folders from path as absolute path string
    """
    for child in Path(path).iterdir():
        yield str(child)
        if child.is_dir():
            for grand_child in all_files(str(child)):
                yield str(Path(grand_child))


def zip_dir(path):
    """generate a zip"""
    zip_filename = zip_name(path)
    zip_file = zipfile.ZipFile(zip_filename, 'w')
    print('create:', zip_filename)
    for file in all_files(path):
        print('adding... ', file)
        zip_file.write(file)
    zip_file.close()


if __name__ == '__main__':
    zip_dir('.')
    print('end!')

现代Python（3.6+）使用pathlib模块对路径进行类似OOP的简洁处理，使用pathlib.Path.rglob（）进行递归globing。据我所知，这相当于乔治·V·莱利的回答：压缩压缩，最顶层的元素是目录，保持空目录，使用相对路径。

from pathlib import Path
from zipfile import ZIP_DEFLATED, ZipFile

from os import PathLike
from typing import Union


def zip_dir(zip_name: str, source_dir: Union[str, PathLike]):
    src_path = Path(source_dir).expanduser().resolve(strict=True)
    with ZipFile(zip_name, 'w', ZIP_DEFLATED) as zf:
        for file in src_path.rglob('*'):
            zf.write(file, file.relative_to(src_path.parent))

注意：如可选类型提示所示，zip_name不能是Path对象（将在3.6.2+中修复）。

如何在Python中创建目录结构的zip存档？

在Python脚本中

在Python 2.7+中，shutil有一个make_archive函数。

from shutil import make_archive
make_archive(
  'zipfile_name', 
  'zip',           # the archive format - or tar, bztar, gztar 
  root_dir=None,   # root for archive - current working dir if None
  base_dir=None)   # start archiving from here - cwd if None too

在这里，压缩的归档文件将命名为zipfile_name.zip。如果base_dir距离root_dir更远，它将排除不在base_dir中的文件，但仍将父目录中的文件归档到root_dir。

我在Cygwin上用2.7测试这个时确实遇到了问题——它需要一个root_dir参数，用于cwd：

make_archive('zipfile_name', 'zip', root_dir='.')

从shell使用Python

您也可以使用zipfile模块从shell中使用Python执行此操作：

$ python -m zipfile -c zipname sourcedir

其中zipname是所需目标文件的名称（如果需要，请添加.zip，它不会自动执行），sourcedir是目录的路径。

压缩Python（或者只是不需要父目录）：

如果您试图用__init__.py和__main__.py压缩一个python包，并且不需要父目录

$ python -m zipfile -c zipname sourcedir/*

And

$ python zipname

将运行程序包。（请注意，不能将子包作为压缩存档的入口点运行。）

压缩Python应用程序：

如果您有python3.5+，并且特别想压缩Python包，请使用ziapp:

$ python -m zipapp myapp
$ python myapp.pyz

显而易见的方法是使用shutil，就像第二个顶级答案所说的那样，但如果出于某种原因，您仍然希望使用ZipFile，并且如果您在执行此操作时遇到一些问题（如Windows等中的ERR 13），您可以使用此修复程序：

import os
import zipfile

def retrieve_file_paths(dirName):
  filePaths = []
  for root, directories, files in os.walk(dirName):
    for filename in files:
        filePath = os.path.join(root, filename)
        filePaths.append(filePath)
  return filePaths
 
def main(dir_name, output_filename):
  filePaths = retrieve_file_paths(dir_name)
   
  zip_file = zipfile.ZipFile(output_filename+'.zip', 'w')
  with zip_file:
    for file in filePaths:
      zip_file.write(file)

main("my_dir", "my_dir_archived")

该方法递归地遍历给定文件夹中的每个子文件夹/文件，并将它们写入zip文件，而不是尝试直接压缩文件夹。

正如其他人所指出的，您应该使用zipfile。文档告诉哪些函数可用，但并没有真正解释如何使用它们压缩整个目录。我认为用一些示例代码来解释是最简单的：

import os
import zipfile
    
def zipdir(path, ziph):
    # ziph is zipfile handle
    for root, dirs, files in os.walk(path):
        for file in files:
            ziph.write(os.path.join(root, file), 
                       os.path.relpath(os.path.join(root, file), 
                                       os.path.join(path, '..')))

with zipfile.ZipFile('Python.zip', 'w', zipfile.ZIP_DEFLATED) as zipf:
    zipdir('tmp/', zipf)