我试图使用scikit-learn的LabelEncoder来编码字符串标签的pandas DataFrame。由于数据帧有许多(50+)列,我想避免为每一列创建一个LabelEncoder对象;我宁愿只有一个大的LabelEncoder对象,它可以跨所有数据列工作。
将整个DataFrame扔到LabelEncoder中会产生以下错误。请记住,我在这里使用的是虚拟数据;实际上,我正在处理大约50列的字符串标记数据,所以需要一个解决方案,不引用任何列的名称。
import pandas
from sklearn import preprocessing
df = pandas.DataFrame({
'pets': ['cat', 'dog', 'cat', 'monkey', 'dog', 'dog'],
'owner': ['Champ', 'Ron', 'Brick', 'Champ', 'Veronica', 'Ron'],
'location': ['San_Diego', 'New_York', 'New_York', 'San_Diego', 'San_Diego',
'New_York']
})
le = preprocessing.LabelEncoder()
le.fit(df)
回溯(最近一次调用):
文件“”,第1行,在
文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/预处理/label.py",第103行
y = column_or_1d(y, warn=True)
文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/validation.py",第306行,在column_or_1d中
raise ValueError("错误的输入形状{0}".format(形状))
ValueError:错误的输入形状(6,3)
对于如何解决这个问题有什么想法吗?
从scikit-learn 0.20开始,你可以使用sklearn.compose.ColumnTransformer和sklearn.预处理. onehotencoder:
如果你只有分类变量,OneHotEncoder直接:
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
OneHotEncoder(handle_unknown='ignore').fit_transform(df)
如果你有异构类型的特性:
from sklearn.compose import make_column_transformer
from sklearn.preprocessing import RobustScaler
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
categorical_columns = ['pets', 'owner', 'location']
numerical_columns = ['age', 'weigth', 'height']
column_trans = make_column_transformer(
(categorical_columns, OneHotEncoder(handle_unknown='ignore'),
(numerical_columns, RobustScaler())
column_trans.fit_transform(df)
文档中有更多选项:http://scikit-learn.org/stable/modules/compose.html#columntransformer-for-heterogeneous-data
你可以很容易地做到,
df.apply(LabelEncoder().fit_transform)
EDIT2:
在scikit-learn 0.20中,推荐的方法是
OneHotEncoder().fit_transform(df)
因为OneHotEncoder现在支持字符串输入。
使用ColumnTransformer可以只对某些列应用OneHotEncoder。
编辑:
由于这个最初的答案是一年多前的,并获得了许多赞(包括赏金),我可能应该进一步扩展它。
对于inverse_transform和transform,你需要做一点修改。
from collections import defaultdict
d = defaultdict(LabelEncoder)
这样,您现在将所有列LabelEncoder保留为字典。
# Encoding the variable
fit = df.apply(lambda x: d[x.name].fit_transform(x))
# Inverse the encoded
fit.apply(lambda x: d[x.name].inverse_transform(x))
# Using the dictionary to label future data
df.apply(lambda x: d[x.name].transform(x))
MOAR编辑:
使用Neuraxle的flatforeach步骤,也可以在一次对所有平坦数据使用相同的LabelEncoder:
FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True).fit_transform(df)
要根据数据列使用单独的LabelEncoders,或者如果只有一些数据列需要进行标签编码,而不需要其他数据列,那么使用ColumnTransformer是一种解决方案,它允许对列选择和LabelEncoder实例进行更多控制。