我想用IPython笔记本电脑来交互式分析我用Biopython的基因组图模块制作的一些基因组图。虽然有大量关于如何使用matplotlib在IPython笔记本中获得内联图形的文档，但GenomeDiagram使用ReportLab工具包，我认为IPython不支持该工具包。

然而，我在想，一种解决这个问题的方法是将绘图/基因组图写入一个文件，然后内联打开图像，结果会是这样的:

gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")

然而，我不知道如何做到这一点，也不知道这是否可行。那么有人知道IPython中是否可以打开/显示图像吗?

我经常在超过1500万行左右的数据帧上执行pandas操作，我希望能够访问特定操作的进度指示器。

是否存在基于文本的熊猫分裂-应用-组合操作进度指示器?

例如:

df_users.groupby(['userID', 'requestDate']).apply(feature_rollup)

其中feature_rollup是一个有点复杂的函数，它采用许多DF列，并通过各种方法创建新的用户列。对于大数据帧，这些操作可能需要一段时间，所以我想知道是否有可能在iPython笔记本中有基于文本的输出，以更新我的进度。

到目前为止，我已经尝试了Python的规范循环进度指示器，但它们没有以任何有意义的方式与pandas交互。

我希望在pandas库/文档中有一些我忽略了的东西，可以让人们了解分裂-应用-组合的进展。一个简单的实现可能会查看apply函数正在处理的数据帧子集的总数，并将进度报告为这些子集的完成部分。

这可能是需要添加到库中的东西吗?

当我打开Jupyter笔记本(以前是IPython)时，它默认为c:\ users \ username

我如何将其更改为另一个位置?

我想得到的时间花在单元格执行除了原始的输出从单元格。

为此，我尝试了%%timeit -r1 -n1，但它没有公开在cell中定义的变量。

%%time适用于只包含1条语句的cell。

In[1]: %%time
       1
CPU times: user 4 µs, sys: 0 ns, total: 4 µs
Wall time: 5.96 µs
Out[1]: 1

In[2]: %%time
       # Notice there is no out result in this case.
       x = 1
       x
CPU times: user 3 µs, sys: 0 ns, total: 3 µs
Wall time: 5.96 µs

最好的方法是什么?

更新

我已经在nbeextension中使用执行时间相当长一段时间了。这是伟大的。

更新2021 - 03

到目前为止，这是正确的答案。从本质上讲，%%time和%%timeit现在都像预期的那样工作。

我开始严重依赖IPython笔记本应用程序来开发和记录算法。这太棒了;但有些事情看起来应该是可能的，但我不知道该怎么做:

I would like to insert a local image into my (local) IPython notebook markdown to aid in documenting an algorithm. I know enough to add something like <img src="image.png"> to the markdown, but that is about as far as my knowledge goes. I assume I could put the image in the directory represented by 127.0.0.1:8888 (or some subdirectory) to be able to access it, but I can't figure out where that directory is. (I'm working on a mac.) So, is it possible to do what I'm trying to do without too much trouble?

我有木星/anaconda/python3.5。

我如何知道我的jupyter笔记本在哪个conda环境上运行? 如何从新的conda环境中启动jupyter ?

如何在IPython Notebook中显示LaTeX代码?

我的Jupyter笔记本电脑安装了python 2内核。我不明白为什么。我可能在安装的时候搞砸了。我已经安装了python 3。我怎么能把它加到木星上? 下面是默认的Jupyter使用python3 -m install Jupyter安装并在浏览器中使用Jupyter notebook打开的截图:

我正在考虑使用*。Ipynb文件作为真相的来源，并以编程方式将它们“编译”为.py文件，用于计划的作业/任务。

我所理解的做到这一点的唯一方法是通过GUI。有没有办法通过命令行来实现?

我在Ipython Notebook上使用“%matplotlib inline”使我的绘图内联。

现在，情节出现了。然而，它非常小。有没有办法让它看起来更大使用笔记本设置或情节设置?