对于那些使用SSH连接到MySQL数据库的人来说，这里似乎缺少一个答案。你需要检查两个地方，而不是其他答案建议的1:

工作台编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS

工作台编辑→首选项→SSH→超时

我的默认SSH超时设置得很低，导致了一些(但显然不是全部)超时问题。之后，不要忘记重新启动MySQL工作台!

最后，你可以联系你的数据库管理员，让他们通过my.conf + mysql restart来增加mysql自身的wait_timeout和interactive_timeout属性，如果重启mysql不是一个选项，也可以做一个全局设置。

希望这能有所帮助!

如果你的查询有blob数据，这个问题可以通过应用my.ini更改来修复，就像在这个答案中提出的那样:

[mysqld]
max_allowed_packet=16M

默认情况下，这将是1M(允许的最大值是1024M)。如果提供的值不是1024K的倍数，它将自动舍入到1024K的最接近倍数。

虽然引用的线程是关于MySQL错误2006，设置max_allowed_packet从1M到16M确实修复了2013年的错误，当我运行一个长查询时出现。

对于WAMP用户:您将在[wampmysqld]部分中找到该标志。

原来我们的防火墙规则阻止了我连接MYSQL。在解除防火墙策略以允许连接后，我能够成功地导入架构。

此错误消息有三个可能的原因

通常这表明网络连接有问题，如果经常发生这种错误，您应该检查网络的状况 有时，当数百万行作为一个或多个查询的一部分发送时，就会出现“during query”形式。 更罕见的情况是，当客户端尝试到服务器的初始连接时，也会发生这种情况

更多细节请阅读>>

原因2:

SET GLOBAL interactive_timeout=60;

从默认的30秒到60秒或更长时间

原因3:

SET GLOBAL connect_timeout=60;

对我来说，以上都没用。然后我尝试停止mysql服务，并再次启动它，神奇地查询开始运行:D。

$ sudo service mysql stop
$ sudo service mysql start

希望这能有所帮助

至:

编辑->首选项-> SQL编辑器

在“MySQL Session”组中可以看到三个字段，现在可以在其中设置新的连接间隔(以秒为单位)。