给定命令是我建议的最佳解决方案。

git subtree add --prefix=MY_PROJECT git://github.com/project/my_project.git master

我想把一个小项目移到一个大项目的子目录中。由于我的小项目没有很多提交，所以我使用了git格式的patch--output directory/path/to/patch dir。然后在更大的项目中，我使用了git-am-directory=dir/in/project/path/to/patch-dir/*。

这感觉比过滤器分支不那么可怕，也更干净。当然，它可能不适用于所有情况。

如果您试图简单地将两个存储库粘合在一起，那么子模块和子树合并是错误的工具，因为它们不能保留所有的文件历史记录（正如人们在其他答案中所指出的）。请参阅此处的答案，了解简单而正确的方法。

如果两个存储库都有相同类型的文件（就像两个Rails存储库用于不同的项目），您可以将辅助存储库的数据提取到当前存储库中：

git fetch git://repository.url/repo.git master:branch_name

然后将其合并到当前存储库：

git merge --allow-unrelated-histories branch_name

如果您的Git版本小于2.9，请删除--允许不相关的历史记录。

在此之后，可能会发生冲突。例如，可以使用gitmergetool来解析它们。kdiff3只能与键盘一起使用，因此在读取代码时仅需几分钟，就会产生5个冲突文件。

记住完成合并：

git commit

我知道事情已经过去很久了，但我对我在这里找到的其他答案并不满意，所以我写了这样一篇文章：

me=$(basename $0)

TMP=$(mktemp -d /tmp/$me.XXXXXXXX)
echo 
echo "building new repo in $TMP"
echo
sleep 1

set -e

cd $TMP
mkdir new-repo
cd new-repo
    git init
    cd ..

x=0
while [ -n "$1" ]; do
    repo="$1"; shift
    git clone "$repo"
    dirname=$(basename $repo | sed -e 's/\s/-/g')
    if [[ $dirname =~ ^git:.*\.git$ ]]; then
        dirname=$(echo $dirname | sed s/.git$//)
    fi

    cd $dirname
        git remote rm origin
        git filter-branch --tree-filter \
            "(mkdir -p $dirname; find . -maxdepth 1 ! -name . ! -name .git ! -name $dirname -exec mv {} $dirname/ \;)"
        cd ..

    cd new-repo
        git pull --no-commit ../$dirname
        [ $x -gt 0 ] && git commit -m "merge made by $me"
        cd ..

    x=$(( x + 1 ))
done

git子树很好，但它可能不是您想要的。

例如，如果projectA是在B中创建的目录，在git子树之后，

git log projectA

仅列出一个提交：合并。合并项目的提交针对不同的路径，因此不会显示。

格雷格·休吉尔（Greg Hewgill）的答案最接近，但实际上并没有说明如何重写路径。

解决方案出奇地简单。

（1） 在A中，

PREFIX=projectA #adjust this

git filter-branch --index-filter '
    git ls-files -s |
    sed "s,\t,&'"$PREFIX"'/," |
    GIT_INDEX_FILE=$GIT_INDEX_FILE.new git update-index --index-info &&
    mv $GIT_INDEX_FILE.new $GIT_INDEX_FILE
' HEAD

注意：这将重写历史；你可能想先备份a。

注意Bene：如果在文件名或路径中使用非ascii字符（或白色字符），则必须修改sed命令中的替代脚本。在这种情况下，“ls files-s”生成的记录中的文件位置以引号开头。

（2） 然后在B中，运行

git pull path/to/A

瞧！在B中有一个projectA目录。如果运行git-log-projectA，您将看到a中的所有提交。

在我的例子中，我需要两个子目录，projectA和projectB。在这种情况下，我也执行了步骤（1）到B。