我正在考虑使用*。Ipynb文件作为真相的来源,并以编程方式将它们“编译”为.py文件,用于计划的作业/任务。

我所理解的做到这一点的唯一方法是通过GUI。有没有办法通过命令行来实现?


当前回答

下面是一种不使用ipython就可以从V3或V4 ipynb中提取代码的快速而简单的方法。它不检查单元格类型等。

import sys,json

f = open(sys.argv[1], 'r') #input.ipynb
j = json.load(f)
of = open(sys.argv[2], 'w') #output.py
if j["nbformat"] >=4:
        for i,cell in enumerate(j["cells"]):
                of.write("#cell "+str(i)+"\n")
                for line in cell["source"]:
                        of.write(line)
                of.write('\n\n')
else:
        for i,cell in enumerate(j["worksheets"][0]["cells"]):
                of.write("#cell "+str(i)+"\n")
                for line in cell["input"]:
                        of.write(line)
                of.write('\n\n')

of.close()

其他回答

下面是一种不使用ipython就可以从V3或V4 ipynb中提取代码的快速而简单的方法。它不检查单元格类型等。

import sys,json

f = open(sys.argv[1], 'r') #input.ipynb
j = json.load(f)
of = open(sys.argv[2], 'w') #output.py
if j["nbformat"] >=4:
        for i,cell in enumerate(j["cells"]):
                of.write("#cell "+str(i)+"\n")
                for line in cell["source"]:
                        of.write(line)
                of.write('\n\n')
else:
        for i,cell in enumerate(j["worksheets"][0]["cells"]):
                of.write("#cell "+str(i)+"\n")
                for line in cell["input"]:
                        of.write(line)
                of.write('\n\n')

of.close()

在你的工具链中有Jupytext是很好的。它不仅允许从笔记本到脚本的转换,而且还可以从脚本返回到笔记本。甚至把那本笔记本打印出来。

jupytext --to py notebook.ipynb                 # convert notebook.ipynb to a .py file
jupytext --to notebook notebook.py              # convert notebook.py to an .ipynb file with no outputs
jupytext --to notebook --execute notebook.py    # convert notebook.py to an .ipynb file and run it 

没有文件/目录错误

在我的mint [ubuntu]系统上,尽管已经安装了jupyter,笔记本电脑也可以工作,但jupyter nbconvert——to脚本给出了错误,没有文件/目录,直到我做了一个单独的

sudo apt-get install jupyter-nbconvert

然后一切都很顺利。我只是想添加这个,以防有人碰到同样的错误(对我来说,这是令人困惑的,因为我认为没有文件错误指向笔记本,它肯定在本地目录中,我花了一段时间才意识到子命令没有安装)。

下面的示例将一个名为a_notebook的Iron Python Notebook转换为。ipynb转换到一个名为a_python_script.py的python脚本中,省略带有关键字remove的单元格,我手动将其添加到我不想在脚本中结束的单元格中,省略了可视化和其他步骤,一旦我完成了笔记本,我不需要由脚本执行。

import nbformat as nbf
from nbconvert.exporters import PythonExporter
from nbconvert.preprocessors import TagRemovePreprocessor

with open("a_notebook.ipynb", 'r', encoding='utf-8') as f:
    the_notebook_nodes = nbf.read(f, as_version = 4)

trp = TagRemovePreprocessor()

trp.remove_cell_tags = ("remove",)

pexp = PythonExporter()

pexp.register_preprocessor(trp, enabled= True)

the_python_script, meta = pexp.from_notebook_node(the_notebook_nodes)

with open("a_python_script.py", 'w', encoding='utf-8') as f:
    f.writelines(the_python_script)

您可以从IPython API完成此操作。

from IPython.nbformat import current as nbformat
from IPython.nbconvert import PythonExporter

filepath = 'path/to/my_notebook.ipynb'
export_path = 'path/to/my_notebook.py'

with open(filepath) as fh:
    nb = nbformat.reads_json(fh.read())

exporter = PythonExporter()

# source is a tuple of python source code
# meta contains metadata
source, meta = exporter.from_notebook_node(nb)

with open(export_path, 'w+') as fh:
    fh.writelines(source)