我认为这是一篇很好的文章，解释了两者之间的区别，以及什么时候应该使用其中一种: http://tag1consulting.com/MySQL_Engines_MyISAM_vs_InnoDB

有点晚了…但这是我几个月前写的一篇相当全面的文章，详细介绍了MYISAM和InnoDB之间的主要区别。喝杯茶(或者一块饼干)，好好享受吧。

MyISAM和InnoDB之间的主要区别在于引用完整性和事务。还有其他区别，如锁定、回滚和全文搜索。

参照完整性

Referential integrity ensures that relationships between tables remains consistent. More specifically, this means when a table (e.g. Listings) has a foreign key (e.g. Product ID) pointing to a different table (e.g. Products), when updates or deletes occur to the pointed-to table, these changes are cascaded to the linking table. In our example, if a product is renamed, the linking table’s foreign keys will also update; if a product is deleted from the ‘Products’ table, any listings which point to the deleted entry will also be deleted. Furthermore, any new listing must have that foreign key pointing to a valid, existing entry.

InnoDB是一个关系DBMS (RDBMS)，因此具有引用完整性，而MyISAM没有。

事务和原子性

表中的数据使用数据操作语言(DML)语句进行管理，例如SELECT、INSERT、UPDATE和DELETE。事务将两个或多个DML语句组合到一个工作单元中，因此可以应用整个工作单元，也可以不应用任何工作单元。

MyISAM不支持事务，而InnoDB支持。

如果在使用MyISAM表时操作中断，操作将立即中止，受影响的行(甚至是每行中的数据)仍然受到影响，即使操作没有完成。

如果一个操作在使用InnoDB表时被中断，因为它使用事务，具有原子性，任何没有完成的事务都不会生效，因为没有提交。

表锁vs行锁

当对MyISAM表执行查询时，所查询的整个表将被锁定。这意味着后续查询只会在当前查询完成后执行。如果您正在读取一个大的表，并且/或者有频繁的读和写操作，这可能意味着大量的查询积压。

当对InnoDB表执行查询时，只有涉及的行被锁定，表的其余部分仍可用于CRUD操作。这意味着查询可以在同一个表上同时运行，前提是它们不使用同一行。

这个特性在InnoDB中被称为并发。尽管并发性很好，但对于选择的表范围有一个主要缺点，即在内核线程之间切换时会产生开销，您应该对内核线程设置一个限制，以防止服务器停止。

事务和回滚

当你在MyISAM中运行一个操作时，更改被设置;在InnoDB中，这些更改可以回滚。用于控制事务的最常用命令是COMMIT、ROLLBACK和SAVEPOINT。1. COMMIT -你可以写多个DML操作，但是只有在COMMIT时更改才会被保存。ROLLBACK -你可以放弃任何尚未提交的操作。SAVEPOINT—设置ROLLBACK操作可以回滚到的操作列表中的一个点

可靠性

MyISAM不提供数据完整性——硬件故障、不干净的关机和取消的操作都可能导致数据损坏。这将需要完全修复或重新构建索引和表。

另一方面，InnoDB使用事务日志、双写缓冲区和自动校验和验证来防止损坏。在InnoDB做任何更改之前，它会将事务之前的数据记录到一个名为ibdata1的系统表空间文件中。如果出现崩溃，InnoDB会通过重放这些日志自动恢复。

全文索引

InnoDB直到MySQL 5.6.4版本才支持FULLTEXT索引。在撰写本文时，许多共享主机提供商的MySQL版本仍然低于5.6.4，这意味着InnoDB表不支持FULLTEXT索引。

然而，这并不是使用MyISAM的正当理由。最好换一个支持最新版本MySQL的主机提供商。并不是说使用FULLTEXT索引的MyISAM表不能转换为InnoDB表。

结论

总之，InnoDB应该是您的默认存储引擎选择。在满足特定需求时选择MyISAM或其他数据类型。

如果使用MyISAM，则每小时不会执行任何事务，除非将每个DML语句视为一个事务(在任何情况下，在崩溃时都不是持久的或原子的)。

因此我认为你必须使用InnoDB。

每秒300个交易听起来很多。如果您绝对需要这些事务在电源故障时保持持久，请确保您的I/O子系统能够轻松地处理每秒这么多的写操作。您至少需要一个带有电池缓存的RAID控制器。

如果你可以降低一点持久性，你可以使用InnoDB，将innodb_flush_log_at_trx_commit设置为0或2(参见文档)，你可以提高性能。

有许多补丁可以从谷歌和其他补丁中提高并发性——如果没有它们仍然不能获得足够的性能，这些补丁可能会引起您的兴趣。

底线:如果你离线工作，选择大量的数据，MyISAM可能会给你更好的(好得多)速度。

在某些情况下，MyISAM比InnoDB的效率要高得多:离线操作大型数据转储时(因为表锁)。

示例:我正在从NOAA转换一个csv文件(15M条记录)，它使用VARCHAR字段作为键。InnoDB的运行时间很长，即使有大量的内存可用。

这是CSV的一个例子(第一个和第三个字段是键)。

USC00178998,20130101,TMAX,-22,,,7,0700
USC00178998,20130101,TMIN,-117,,,7,0700
USC00178998,20130101,TOBS,-28,,,7,0700
USC00178998,20130101,PRCP,0,T,,7,0700
USC00178998,20130101,SNOW,0,T,,7,

因为我需要做的是运行观察到的天气现象的批量离线更新，我使用MyISAM表接收数据，并在键上运行join，这样我就可以清理传入的文件，并将VARCHAR字段替换为INT键(与原始VARCHAR值存储的外部表相关)。

有点偏离主题，但为了文档的目的和完整性，我想添加以下内容。

一般来说，使用InnoDB会使应用程序变得不那么复杂，可能也更没有bug。因为可以将所有引用完整性(外键约束)放入数据模型中，所以不需要像使用MyISAM时那样多的应用程序代码。

Every time you insert, delete or replace a record, you will HAVE to check and maintain the relationships. E.g. if you delete a parent, all children should be deleted too. For instance, even in a simple blogging system, if you delete a blogposting record, you will have to delete the comment records, the likes, etc. In InnoDB this is done automatically by the database engine (if you specified the contraints in the model) and requires no application code. In MyISAM this will have to be coded into the application, which is very difficult in web-servers. Web-servers are by nature very concurrent / parallel and because these actions should be atomical and MyISAM supports no real transactions, using MyISAM for web-servers is risky / error-prone.

而且在大多数情况下，InnoDB会表现得更好，原因有很多，其中一个原因是它能够使用记录级锁而不是表级锁。不仅在写比读更频繁的情况下，在大型数据集上有复杂连接的情况下也是如此。我们注意到，对于非常大的连接(需要几分钟)，使用InnoDB表比MyISAM表性能提高了3倍。

我想说的是，在使用MySQL时，InnoDB(使用3NF数据模型，具有引用完整性)应该是默认的选择。MyISAM只能在非常具体的情况下使用。它很可能会执行更少，导致应用程序更大，bug更多。

话虽如此。数据模型是一门很少在网页设计师/程序员中发现的艺术。无意冒犯，但这确实解释了MyISAM被如此广泛使用的原因。

InnoDB offers:

ACID transactions
row-level locking
foreign key constraints
automatic crash recovery
table compression (read/write)
spatial data types (no spatial indexes)

在InnoDB中，一行中除TEXT和BLOB外的所有数据最多占用8000字节。InnoDB没有全文索引。在InnoDB中，COUNT(*)s(当WHERE, GROUP BY或JOIN不使用时)执行速度比MyISAM慢，因为行数没有存储在内部。InnoDB将数据和索引存储在一个文件中。InnoDB使用缓冲池来缓存数据和索引。

MyISAM提供：

fast COUNT(*)s (when WHERE, GROUP BY, or JOIN is not used)
full text indexing
smaller disk footprint
very high table compression (read only)
spatial data types and indexes (R-tree)

MyISAM has table-level locking, but no row-level locking. No transactions. No automatic crash recovery, but it does offer repair table functionality. No foreign key constraints. MyISAM tables are generally more compact in size on disk when compared to InnoDB tables. MyISAM tables could be further highly reduced in size by compressing with myisampack if needed, but become read-only. MyISAM stores indexes in one file and data in another. MyISAM uses key buffers for caching indexes and leaves the data caching management to the operating system.

总的来说，我推荐InnoDB用于大多数用途，MyISAM仅用于特殊用途。InnoDB现在是MySQL新版本的默认引擎。