这里有这么多答案，我希望我可以贡献我自己的版本，它基于原始答案（顺便提一下），但具有更图形化的视角，也为每个zipfile设置使用上下文并对os.walk（）进行排序，以便获得有序的输出。

有了这些文件夹和文件（以及其他文件夹），我想为每个cap_文件夹创建一个.zip：

$ tree -d
.
├── cap_01
|    ├── 0101000001.json
|    ├── 0101000002.json
|    ├── 0101000003.json
|
├── cap_02
|    ├── 0201000001.json
|    ├── 0201000002.json
|    ├── 0201001003.json
|
├── cap_03
|    ├── 0301000001.json
|    ├── 0301000002.json
|    ├── 0301000003.json
| 
├── docs
|    ├── map.txt
|    ├── main_data.xml
|
├── core_files
     ├── core_master
     ├── core_slave

以下是我应用的内容，并附有评论，以更好地理解流程。

$ cat zip_cap_dirs.py 
""" Zip 'cap_*' directories. """           
import os                                                                       
import zipfile as zf                                                            


for root, dirs, files in sorted(os.walk('.')):                                                                                               
    if 'cap_' in root:                                                          
        print(f"Compressing: {root}")                                           
        # Defining .zip name, according to Capítulo.                            
        cap_dir_zip = '{}.zip'.format(root)                                     
        # Opening zipfile context for current root dir.                         
        with zf.ZipFile(cap_dir_zip, 'w', zf.ZIP_DEFLATED) as new_zip:          
            # Iterating over os.walk list of files for the current root dir.    
            for f in files:                                                     
                # Defining relative path to files from current root dir.        
                f_path = os.path.join(root, f)                                  
                # Writing the file on the .zip file of the context              
                new_zip.write(f_path) 

基本上，对于os.walk（路径）上的每一次迭代，我都会打开一个用于zipfile设置的上下文，然后对文件进行迭代，这是根目录中的文件列表，根据当前根目录形成每个文件的相对路径，并附加到正在运行的zipfile上下文。

输出如下所示：

$ python3 zip_cap_dirs.py
Compressing: ./cap_01
Compressing: ./cap_02
Compressing: ./cap_03

要查看每个.zip目录的内容，可以使用less命令：

$ less cap_01.zip

Archive:  cap_01.zip
 Length   Method    Size  Cmpr    Date    Time   CRC-32   Name
--------  ------  ------- ---- ---------- ----- --------  ----
  22017  Defl:N     2471  89% 2019-09-05 08:05 7a3b5ec6  cap_01/0101000001.json
  21998  Defl:N     2471  89% 2019-09-05 08:05 155bece7  cap_01/0101000002.json
  23236  Defl:N     2573  89% 2019-09-05 08:05 55fced20  cap_01/0101000003.json
--------          ------- ---                           -------
  67251             7515  89%                            3 files

现代Python（3.6+）使用pathlib模块对路径进行类似OOP的简洁处理，使用pathlib.Path.rglob（）进行递归globing。据我所知，这相当于乔治·V·莱利的回答：压缩压缩，最顶层的元素是目录，保持空目录，使用相对路径。

from pathlib import Path
from zipfile import ZIP_DEFLATED, ZipFile

from os import PathLike
from typing import Union


def zip_dir(zip_name: str, source_dir: Union[str, PathLike]):
    src_path = Path(source_dir).expanduser().resolve(strict=True)
    with ZipFile(zip_name, 'w', ZIP_DEFLATED) as zf:
        for file in src_path.rglob('*'):
            zf.write(file, file.relative_to(src_path.parent))

注意：如可选类型提示所示，zip_name不能是Path对象（将在3.6.2+中修复）。

显而易见的方法是使用shutil，就像第二个顶级答案所说的那样，但如果出于某种原因，您仍然希望使用ZipFile，并且如果您在执行此操作时遇到一些问题（如Windows等中的ERR 13），您可以使用此修复程序：

import os
import zipfile

def retrieve_file_paths(dirName):
  filePaths = []
  for root, directories, files in os.walk(dirName):
    for filename in files:
        filePath = os.path.join(root, filename)
        filePaths.append(filePath)
  return filePaths
 
def main(dir_name, output_filename):
  filePaths = retrieve_file_paths(dir_name)
   
  zip_file = zipfile.ZipFile(output_filename+'.zip', 'w')
  with zip_file:
    for file in filePaths:
      zip_file.write(file)

main("my_dir", "my_dir_archived")

该方法递归地遍历给定文件夹中的每个子文件夹/文件，并将它们写入zip文件，而不是尝试直接压缩文件夹。

您可能想看看zipfile模块；文档位于http://docs.python.org/library/zipfile.html.

您可能还需要os.walk（）来索引目录结构。

正如其他人所指出的，您应该使用zipfile。文档告诉哪些函数可用，但并没有真正解释如何使用它们压缩整个目录。我认为用一些示例代码来解释是最简单的：

import os
import zipfile
    
def zipdir(path, ziph):
    # ziph is zipfile handle
    for root, dirs, files in os.walk(path):
        for file in files:
            ziph.write(os.path.join(root, file), 
                       os.path.relpath(os.path.join(root, file), 
                                       os.path.join(path, '..')))

with zipfile.ZipFile('Python.zip', 'w', zipfile.ZIP_DEFLATED) as zipf:
    zipdir('tmp/', zipf)

要保留要归档的父目录下的文件夹层次结构，请执行以下操作：

import glob
import os
import zipfile

with zipfile.ZipFile(fp_zip, "w", zipfile.ZIP_DEFLATED) as zipf:
    for fp in glob(os.path.join(parent, "**/*")):
        base = os.path.commonpath([parent, fp])
        zipf.write(fp, arcname=fp.replace(base, ""))

如果需要，可以将其更改为使用pathlib进行文件globbing。