我试图使用scikit-learn的LabelEncoder来编码字符串标签的pandas DataFrame。由于数据帧有许多(50+)列,我想避免为每一列创建一个LabelEncoder对象;我宁愿只有一个大的LabelEncoder对象,它可以跨所有数据列工作。

将整个DataFrame扔到LabelEncoder中会产生以下错误。请记住,我在这里使用的是虚拟数据;实际上,我正在处理大约50列的字符串标记数据,所以需要一个解决方案,不引用任何列的名称。

import pandas
from sklearn import preprocessing 

df = pandas.DataFrame({
    'pets': ['cat', 'dog', 'cat', 'monkey', 'dog', 'dog'], 
    'owner': ['Champ', 'Ron', 'Brick', 'Champ', 'Veronica', 'Ron'], 
    'location': ['San_Diego', 'New_York', 'New_York', 'San_Diego', 'San_Diego', 
                 'New_York']
})

le = preprocessing.LabelEncoder()

le.fit(df)

回溯(最近一次调用): 文件“”,第1行,在 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/预处理/label.py",第103行 y = column_or_1d(y, warn=True) 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/validation.py",第306行,在column_or_1d中 raise ValueError("错误的输入形状{0}".format(形状)) ValueError:错误的输入形状(6,3)

对于如何解决这个问题有什么想法吗?


当前回答

正如larsmans提到的,LabelEncoder()只接受1维数组作为参数。也就是说,可以很容易地滚动自己的标签编码器,对您选择的多个列进行操作,并返回转换后的数据框架。我在这里的代码部分基于Zac Stewart的优秀博客文章。

创建自定义编码器只需要创建一个响应fit()、transform()和fit_transform()方法的类。对你来说,一个好的开始可能是这样的:

import pandas as pd
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from sklearn.pipeline import Pipeline

# Create some toy data in a Pandas dataframe
fruit_data = pd.DataFrame({
    'fruit':  ['apple','orange','pear','orange'],
    'color':  ['red','orange','green','green'],
    'weight': [5,6,3,4]
})

class MultiColumnLabelEncoder:
    def __init__(self,columns = None):
        self.columns = columns # array of column names to encode

    def fit(self,X,y=None):
        return self # not relevant here

    def transform(self,X):
        '''
        Transforms columns of X specified in self.columns using
        LabelEncoder(). If no columns specified, transforms all
        columns in X.
        '''
        output = X.copy()
        if self.columns is not None:
            for col in self.columns:
                output[col] = LabelEncoder().fit_transform(output[col])
        else:
            for colname,col in output.iteritems():
                output[colname] = LabelEncoder().fit_transform(col)
        return output

    def fit_transform(self,X,y=None):
        return self.fit(X,y).transform(X)

假设我们想对两个分类属性(fruit和color)进行编码,而不使用数字属性权重。我们可以这样做:

MultiColumnLabelEncoder(columns = ['fruit','color']).fit_transform(fruit_data)

它转换了我们的fruit_data数据集

to

传递给它一个完全由分类变量组成的数据框架,省略columns参数将导致每个列都被编码(我相信这是你最初寻找的):

MultiColumnLabelEncoder().fit_transform(fruit_data.drop('weight',axis=1))

这个转换

to

.

请注意,当它试图编码已经是数值的属性时可能会阻塞(如果您愿意,可以添加一些代码来处理这个问题)。

另一个很好的特性是我们可以在管道中使用这个自定义转换器:

encoding_pipeline = Pipeline([
    ('encoding',MultiColumnLabelEncoder(columns=['fruit','color']))
    # add more pipeline steps as needed
])
encoding_pipeline.fit_transform(fruit_data)

其他回答

这是我解决你问题的办法。为了将包含文本的数据帧列转换为编码值,只需使用我的函数text_to_numbers,它返回LE的字典。Key是列LabelEncoder()作为值的列名。

def text_to_numbers(df):
        le_dict = dict()
        for i in df.columns:
            if df[i].dtype not in ["float64", "bool", "int64"]:
                le_dict[i] = preprocessing.LabelEncoder()
                df[i] = le_dict[i].fit_transform(df[i])
    
        return df, le_dict

下面的函数将使保留原始的未编码数据帧成为可能。

 def numbers_to_text(df, le_dict):
        for i in le_dict.keys():
            df[i] = le_dict[i].inverse_transform(df[i])
    
        return df

在这里和其他地方进行了大量的搜索和实验后,我认为你的答案是:

pd.DataFrame(列= df.columns, data = LabelEncoder () .fit_transform (df.values.flatten ()) .reshape (df.shape))

这将跨列保留类别名称:

import pandas as pd
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder

df = pd.DataFrame([['A','B','C','D','E','F','G','I','K','H'],
                   ['A','E','H','F','G','I','K','','',''],
                   ['A','C','I','F','H','G','','','','']], 
                  columns=['A1', 'A2', 'A3','A4', 'A5', 'A6', 'A7', 'A8', 'A9', 'A10'])

pd.DataFrame(columns=df.columns, data=LabelEncoder().fit_transform(df.values.flatten()).reshape(df.shape))

    A1  A2  A3  A4  A5  A6  A7  A8  A9  A10
0   1   2   3   4   5   6   7   9   10  8
1   1   5   8   6   7   9   10  0   0   0
2   1   3   9   6   8   7   0   0   0   0

下面是我一次性转换多列的解决方案,以及精确的inverse_transform

from sklearn import preprocessing
columns = ['buying','maint','lug_boot','safety','cls']  # columns names where transform is required
for X in columns:
  exec(f'le_{X} = preprocessing.LabelEncoder()')  #create label encoder with name "le_X", where X is column name
  exec(f'df.{X} = le_{X}.fit_transform(df.{X})')  #execute fit transform for column X with respective lable encoder "le_X", where X is column name
df.head()  # to display transformed results

for X in columns:
  exec(f'df.{X} = le_{X}.inverse_transform(df.{X})')  #execute inverse_transform for column X with respective lable encoder "le_X", where X is column name
df.head() # to display Inverse transformed results of df

我们不需要LabelEncoder。

您可以将列转换为类别,然后获取它们的代码。我使用下面的字典推导将此过程应用于每一列,并将结果包装回具有相同索引和列名的相同形状的数据框架中。

>>> pd.DataFrame({col: df[col].astype('category').cat.codes for col in df}, index=df.index)
   location  owner  pets
0         1      1     0
1         0      2     1
2         0      0     0
3         1      1     2
4         1      3     1
5         0      2     1

要创建映射字典,你可以使用字典理解式枚举类别:

>>> {col: {n: cat for n, cat in enumerate(df[col].astype('category').cat.categories)} 
     for col in df}

{'location': {0: 'New_York', 1: 'San_Diego'},
 'owner': {0: 'Brick', 1: 'Champ', 2: 'Ron', 3: 'Veronica'},
 'pets': {0: 'cat', 1: 'dog', 2: 'monkey'}}

使用Neuraxle

TLDR;你可以在这里使用flatforeach包装类简单地转换你的df,如:

使用这种方法,您的标签编码器将能够在常规的scikit-learn Pipeline中适应和转换。让我们简单地导入:

from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from neuraxle.steps.column_transformer import ColumnTransformer
from neuraxle.steps.loop import FlattenForEach

列的共享编码器相同:

下面是一个共享的LabelEncoder将如何应用于所有数据来编码:

    p = FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [6, 7, 6, 8, 7, 7],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)

每列不同的编码器:

这里是第一个独立的LabelEncoder将如何应用于宠物,第二个将为列的所有者和位置共享。所以准确地说,我们这里有一个不同的和共享的标签编码器的组合:

    p = ColumnTransformer([
        # A different encoder will be used for column 0 with name "pets":
        (0, FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
        # A shared encoder will be used for column 1 and 2, "owner" and "location":
        ([1, 2], FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
    ], n_dimension=2)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [0, 1, 0, 2, 1, 1],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)