我很确定这可能是由XCode 4的错误引起的，至少在我遇到的情况下是这样。

如果您同时向项目添加多个依赖于语言的文件，就会发生这种情况。我通过查看git差异发现了这一点。我在提交中什么也没做，只是添加了一些新的本地化的nib文件。但是回顾这个项目的不同之处。在Pbxproj文件中，它显示了一堆新的重复引用，为之前已经在项目中的文件添加。在我看来，它这样做的文件也是随机的。

我重复了很多次同样的行为。

从项目中删除这些文件并不能解决问题，因为它只删除原始引用并留下重复的引用。修复它的唯一方法是返回提交并重新开始，或者手工编辑项目文件，这是一种非常好的方法，因为很难判断要删除哪些重复的文件，而且你必须在大量不同的地方进行修改。

Xcode 4让我非常失望。

几分钟前我也遇到了同样的问题。我提到过改变“部署目标”可以解决我的问题。

这很容易在添加基于git的子项目时引起。Xcode还没有聪明到忽略。git子文件夹，即使你在finder中看不到它，所以它会非常困惑，因为有多个名为“master”或“exclude”的文件(标准的git回购文件)。使用Xcode4，转到项目(左侧树的根)，然后单击应用目标并展开“复制Bundle Resources”，然后删除所有对.git的引用，无论如何你都不应该将它们添加到应用中。

打开项目中的框架文件夹，确保里面只有框架。我错误地添加了整个开发者文件夹!

如果项目中有两个名称相同的文件，就会发生这种情况。即使在XCode中文件是分组的，当项目编译时，所有文件最终都在同一个目录中。换句话说，如果您有/group1/image.jpg和/group2/image.jpg，编译后的项目将只有两个image.jpg文件中的一个。

这不是一个bug。Xcode辅助可以帮助你。在项目Navigator的左侧选择目标。点击设置底部的“验证设置”。Xcode会检查设置并删除重复项。