我找到了一个非常简单的解决方法:

从项目导航器中选择导致问题的文件 从文件检查器中取消选中目标成员 构建项目 再次检查文件的目标成员

警告不见了!检查此图像作为参考。

这很容易在添加基于git的子项目时引起。Xcode还没有聪明到忽略。git子文件夹，即使你在finder中看不到它，所以它会非常困惑，因为有多个名为“master”或“exclude”的文件(标准的git回购文件)。使用Xcode4，转到项目(左侧树的根)，然后单击应用目标并展开“复制Bundle Resources”，然后删除所有对.git的引用，无论如何你都不应该将它们添加到应用中。

Swift 3:(旧版本也是如此)当我拥有带有副本的资产时就会发生这种情况。只要用这个问题重命名文件，一切都会顺利进行。

当你创造了资产时也会发生这种情况。Xcassets和你已经重命名了副本的新名称，所以在时间之后，你忘记了它，并删除它以添加文件夹引用，但这一个返回到重复文件的问题。

实际上，这个问题的答案很简单。

在你的Xcode项目中搜索引发警告的文件，并删除其中一个。

Xcode只会在搜索结果中显示该文件的一个引用，但不要止步于此，直接删除它。(最好在删除之前备份项目文件)

现在再次构建项目。警告现在应该消失了。 (这个答案是以前版本的xcode)

对我来说，目标>构建设置>包装>产品名称被设置为与我的应用程序自定义的.plist文件中引用的另一个值相同的东西。最终，由于我们的构建过程，这创建了重复的文件。

打开项目中的框架文件夹，确保里面只有框架。我错误地添加了整个开发者文件夹!