我自己刚算出来的。为了确保脚本的可移植性，总是以以下开头:

wd <- setwd(".")
setwd(wd)

It works because "." translates like the Unix command $PWD. Assigning this string to a character object allows you to then insert that character object into setwd() and Presto your code will always run with its current directory as the working directory, no matter whose machine it is on or where in the file structure it is located. (Extra bonus: The wd object can be used with file.path() (ie. file.path(wd, "output_directory") to allow for the creation of a standard output directory regardless of the file path leading to your named directory. This does require you to make the new directory before referencing it this way but that, too, can be aided with the wd object.

或者，下面的代码执行完全相同的事情:

wd <- getwd()
setwd(wd)

或者，如果你不需要对象中的文件路径，你可以简单地:

setwd(".")

在我看来，从R脚本的获取路径中得到的rakensi的答案是最正确和真正精彩的。然而，它仍然是一个包含哑函数的黑客。我在这里引用它，是为了让别人更容易发现。

sourceDir <- getSrcDirectory(函数(dummy) {dummy})

这给出了放置语句的文件的目录(在那里定义了dummy函数)。然后可以使用它来设置工作目录并使用相对路径。

setwd(sourceDir)
source("other.R")

或者创建绝对路径

 source(paste(sourceDir, "/other.R", sep=""))

这个问题有一个简单的解决办法。这个命令:

script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)

返回当前脚本文件的路径。它在保存脚本后工作。

你可以使用commandArgs函数获取Rscript传递给实际R解释器的所有选项，并搜索——file=。如果你的脚本是从路径启动的，或者它是以一个完整的路径启动的，下面的script.name将以'/'开头。否则，它必须是相对于cwd，你可以连接两个路径，以获得完整的路径。

编辑:听起来你只需要上面的script.name，并剥离路径的最后一个组件。我已经删除了不需要的cwd()样本，并清理了主脚本，并张贴了我的其他. r。只需要保存这个脚本和其他脚本。R脚本放到同一个目录下，chmod +x它们，然后运行主脚本。

主要。接待员:

#!/usr/bin/env Rscript
initial.options <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
file.arg.name <- "--file="
script.name <- sub(file.arg.name, "", initial.options[grep(file.arg.name, initial.options)])
script.basename <- dirname(script.name)
other.name <- file.path(script.basename, "other.R")
print(paste("Sourcing",other.name,"from",script.name))
source(other.name)

其他。接待员:

print("hello")

输出:

burner@firefighter:~$ main.R
[1] "Sourcing /home/burner/bin/other.R from /home/burner/bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ bin/main.R
[1] "Sourcing bin/other.R from bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ cd bin
burner@firefighter:~/bin$ main.R
[1] "Sourcing ./other.R from ./main.R"
[1] "hello"

我相信这就是德曼在找的东西。

我喜欢这种方法:

this.file <- sys.frame(tail(grep('source',sys.calls()),n=1))$ofile
this.dir <- dirname(this.file)

我在一个高性能计算集群环境中工作。我在不同的地方开发代码，而不是在生产运行的地方。在开发过程中，我通常从命令行交互式地调用R(而不是使用RStudio)。有很多来源(“foo.R”)正在进行。

在生产运行期间，我通常编写一个bash脚本，尝试不同的参数，并在单独的目录中运行每一组参数。bash脚本利用了工作负载管理器(即SLURM)。在这种环境中，设置环境变量很简单。考虑到这一点，下面的解决方案最适合我。

其他。R

my_message <- function(){
return("R is awkward")
}

foo。R

srcpath = Sys.getenv("R_SRC")
# Check if runnning w/o setting R_SRC - presumably done in directory of development, i.e. /path/to/R/code
if(srcpath == ""){
    srcpath="./"
}
source(sprintf("%s/other.R", srcpath))
string = my_message()
print(string)

如果从R交互式shell中运行，并且在/path/到/R/code中运行，那么简单

> source("foo.R")

如果不是从交互式shell运行，也不是从/path/to/R/code运行，首先设置环境变量R_SRC，然后调用Rscript

$ export R_SRC=/path/to/R/code/
$ Rscript /path/to/R/code/foo.R