我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R，在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R，不管当前工作目录是什么。
换句话说，就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
当前回答
这对我很有用
library(rstudioapi)
rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
其他回答
这对我很有用。只是从命令行参数中greps它，去掉不需要的文本，执行dirname，最后从它获得完整的路径:
args <- commandArgs(trailingOnly = F)
scriptPath <- normalizePath(dirname(sub("^--file=", "", args[grep("^--file=", args)])))
Supressingfire回答的简化版本:
source_local <- function(fname){
argv <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
base_dir <- dirname(substring(argv[grep("--file=", argv)], 8))
source(paste(base_dir, fname, sep="/"))
}
请注意，getopt包提供了get_Rscript_filename函数，该函数使用与本文相同的解决方案，但已经在标准R模块中为您编写了该解决方案，因此您不必将“获取脚本路径”函数复制并粘贴到您编写的每个脚本中。
我对上面的实现有问题，因为我的脚本是从符号链接目录操作的，或者至少这就是为什么我认为上面的解决方案不适合我。按照@ennuikiller的回答，我将Rscript包装在bash中。我使用pwd -P设置路径变量，它解析符号链接目录结构。然后将路径传递给Rscript。
Bash.sh
#!/bin/bash
# set path variable
path=`pwd -P`
#Run Rscript with path argument
Rscript foo.R $path
foo。R
args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
setwd(args[1])
source(other.R)
Steamer25的方法是有效的，但前提是路径中没有空白。在macOS上，至少cmdArgs[match]返回类似/base/some~+~dir~+~带~+~空格/ for /base/some\ dir\带\空格/。
我通过在返回之前用一个简单的空格替换“~+~”来解决这个问题。
thisFile <- function() {
cmdArgs <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle <- "--file="
match <- grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript
path <- cmdArgs[match]
path <- gsub("\\~\\+\\~", " ", path)
return(normalizePath(sub(needle, "", path)))
} else {
# 'source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
}
}
显然，你仍然可以像aprstar那样扩展else块。