我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R，在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R，不管当前工作目录是什么。
换句话说，就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
当前回答
请注意，getopt包提供了get_Rscript_filename函数，该函数使用与本文相同的解决方案，但已经在标准R模块中为您编写了该解决方案，因此您不必将“获取脚本路径”函数复制并粘贴到您编写的每个脚本中。
其他回答
解决方案在2016年出现。非常感谢作者，Sahil Seth!
CRAN和github上的funr包提供了sys.script()函数，该函数获取当前脚本的完整路径。它甚至引用了一个类似的SO帖子。
因此，解是:
myscript。接待员:
#!/usr/bin/env Rscript
f <- funr::sys.script()
show(f)
然后执行命令:
user@somewhere:/home$ Rscript myscript.R
将在命令行输出，例如:
"/home/path/to/myscript.R"
到控制台。
你可以在一个bash脚本中包装r脚本，并检索脚本的路径作为bash变量，如下所示:
#!/bin/bash
# [environment variables can be set here]
path_to_script=$(dirname $0)
R --slave<<EOF
source("$path_to_script/other.R")
EOF
我的一切都在一个!(—2019年9月1日更新以处理RStudio控制台)
#' current script file (in full path)
#' @description current script file (in full path)
#' @examples
#' works with Rscript, source() or in RStudio Run selection, RStudio Console
#' @export
ez.csf <- function() {
# http://stackoverflow.com/a/32016824/2292993
cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle = "--file="
match = grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript via command line
return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
} else {
ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
if ("fileName" %in% ls_vars) {
# Source'd via RStudio
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName))
} else {
if (!is.null(sys.frames()[[1]]$ofile)) {
# Source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
} else {
# RStudio Run Selection
# http://stackoverflow.com/a/35842176/2292993
pth = rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
if (pth!='') {
return(normalizePath(pth))
} else {
# RStudio Console
tryCatch({
pth = rstudioapi::getSourceEditorContext()$path
pth = normalizePath(pth)
}, error = function(e) {
# normalizePath('') issues warning/error
pth = ''
}
)
return(pth)
}
}
}
}
}
我已经将这个问题的答案打包并扩展为rprojroot中的新函数thisfile()。也适用于编织与针织。
我也有这个问题，上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的，但还不够清楚。
我找到了这个，对我来说很优雅的解决方案:
paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")
其中重要的是fileSnapshot()，它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时，路径将以\\作为分隔符返回，因此其余代码只是更改这一点。
我希望这能有所帮助。
