问题可能与文件问题，在我的情况下，问题在重命名文件后得到解决。还没弄清楚原因。

我有一个类似的问题，而试图读取一个制表符分隔表与空格，逗号和引号:

1115794 4218    "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Bacillales", "f__Bacillaceae", ""
1144102 3180    "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Bacillales", "f__Bacillaceae", "g__Bacillus", ""
368444  2328    "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae", "g__Bacteroides", ""



import pandas as pd
# Same error for read_table
counts = pd.read_csv(path_counts, sep='\t', index_col=2, header=None, engine = 'c')

pandas.io.common.CParserError: Error tokenizing data. C error: out of memory

这表明它与C解析引擎(这是默认的)有关。也许换成python会改变一切

counts = pd.read_table(path_counts, sep='\t', index_col=2, header=None, engine='python')

Segmentation fault (core dumped)

这是一个不同的错误。 如果我们继续尝试从表中删除空格，来自python-engine的错误再次改变:

1115794 4218    "k__Bacteria","p__Firmicutes","c__Bacilli","o__Bacillales","f__Bacillaceae",""
1144102 3180    "k__Bacteria","p__Firmicutes","c__Bacilli","o__Bacillales","f__Bacillaceae","g__Bacillus",""
368444  2328    "k__Bacteria","p__Bacteroidetes","c__Bacteroidia","o__Bacteroidales","f__Bacteroidaceae","g__Bacteroides",""


_csv.Error: '   ' expected after '"'

很明显，熊猫在解析我们的行时遇到了问题。为了用python引擎解析一个表，我需要事先从表中删除所有的空格和引号。与此同时，c引擎不断崩溃，即使逗号在行。 为了避免创建一个带有替换的新文件，我这样做了，因为我的表很小:

from io import StringIO
with open(path_counts) as f:
    input = StringIO(f.read().replace('", ""', '').replace('"', '').replace(', ', ',').replace('\0',''))
    counts = pd.read_table(input, sep='\t', index_col=2, header=None, engine='python')

博士tl; 更改解析引擎，尽量避免在数据中使用任何非分隔的引号/逗号/空格。

在我的例子中，问题是熊猫版本，所以熊猫1.3.5就像一个魅力。

我遇到过这样的错误，一个丢失的引号。我使用映射软件，当导出以逗号分隔的文件时，它会在文本项周围加上引号。使用引号的文本(例如:' =英尺和' =英寸)可能会导致分隔符冲突。考虑下面这个例子，5英寸的测井曲线打印很差:

UWI_key,经度,纬度,备注 US42051316890000, 30.4386484, -96.4330734,“可怜的5””

用5英寸作为5英寸的简写，最终会给工作带来麻烦。Excel会简单地去掉额外的引号，但是Pandas没有上面提到的error_bad_lines=False参数就会失效。

这肯定是分隔符的问题，因为大多数csv csv都是使用sep='/t'创建的，所以尝试使用分隔符/t的制表符(\t)来读取csv。所以，尝试使用下面的代码行打开。

data=pd.read_csv("File_path", sep='\t')

据我所知，在查看了您的文件后，问题是您试图加载的csv文件有多个表。有空行，或者包含表标题的行。试着看看这个Stackoverflow的答案。它展示了如何以编程方式实现这一点。

另一种动态方法是使用csv模块，一次读取每一行，并进行健全检查/正则表达式，以推断该行是否为(title/header/values/blank)。使用这种方法还有一个优点，你可以根据需要在python对象中分割/追加/收集数据。

最简单的方法是在手动选择表格并将其复制到剪贴板后使用pandas函数pd.read_clipboard()，以防您可以在excel或其他工具中打开csv。

无关:

此外，与您的问题无关，但因为没有人提到这一点:我在从UCI加载一些数据集(如seeds_dataset.txt)时遇到了同样的问题。在我的例子中，发生错误是因为一些分隔符的空格比真正的制表符多。例如，请参见下面的第3行

14.38   14.21   0.8951  5.386   3.312   2.462   4.956   1
14.69   14.49   0.8799  5.563   3.259   3.586   5.219   1
14.11   14.1    0.8911  5.42    3.302   2.7     5       1

因此，在分隔符模式中使用\t+而不是\t。

data = pd.read_csv(path, sep='\t+`, header=None)